Flora

-Manglar:

Tres especies principales de mangle ocurren en los pantanos del área de estudio: el mangle rojo (Rhyzophora mangle), el blanco (Avicenia sp.) y el negro (Laguncularia racemosa).

-Bosque Ombrófito de Bajura

Existe en parches de bosques inundables en las zonas bajas en condición aún prístina o inalterada.  También se encuentran bosques de galería en las orillas de ríos y quebradas.

-Pantano Herbáceo

En suelos mal drenados, extensiones planas, bajuras, alrededores de lagunas y canales.

-Áreas Alterada

Las áreas alrededor de las principales comunidades del Refugio se encuentran alteradas en la forma de cultivos familiares dedicados a la siembra en pequeña escalde yuca, arroz, caña de azúcar, banano y plátano.